在2001年的圣诞节前夕，东海海域上演的“间谍船事件”给这一地区平添了一层异样的紧张气氛。整个事件犹如好莱坞巨片一样惊险曲折，而事件在过去一年之后才有了一个似乎有了句号的结局。
2001年12月21日下午4时左右，日本海上自卫队巡逻机在巡逻中发现，在距日本鹿儿岛县奄美大岛西北150公里处的日本专属经济海域内有一条左舷标有“长渔3705”字样、排水量100吨左右的国籍不明“形迹可疑”的船只，巡逻机对其实施空中照相，并把相关信息发回自卫队总部进行分析。12月22日凌晨，海上自卫队把相关情报通报给海上保安厅。
日本巡逻艇追击可疑船只交火中将其击沉
在接到通报后，日本海上保安厅当即出动25艘巡逻艇、14架飞机对可疑船只进行追踪和围堵。期间，自卫队甚至出动先进的“宙斯盾”驱逐舰前往助阵。22日早6时20分，日本海上巡逻艇判明了可疑船的所在位置，并在下午1时左右追上了可疑船。海上巡逻艇首先对空鸣枪示警，令其停船。由于可疑船不听劝告，继续沿着一条直线，向正西方向逃窜。下午4时左右，巡逻艇动用20毫米机关炮对可疑船实施直接射击，致使可疑船甲板起火并一度停船，但正当海上保安厅的两艘巡逻艇对可疑船进行夹击，并准备强行登船搜捕时，可疑船上的乘员突然在10时9分向巡逻艇开火射击，造成船身受损，2名警官受伤。交火中可疑船还向巡逻艇发射了2枚反坦克火箭弹，但由于风高浪急，未命中目标。随后该船使用高射机枪与在其左侧的另一艘巡逻船展开对射。一串串炮弹飞向可疑船只，火星四散。4分钟后可疑船发生剧烈爆炸并沉没，15名船失踪，沉没地点在中国领海外约260公里处。事后，日本海上保安厅的巡逻艇仅在沉没现场附近打捞起2具尸体。
沉船在中国专属经济区日方设法打捞
在沉船事件发生之后，日本希望能够打捞沉船以获取真相。由于该船沉没位置位于中国专属经济区内，日方的打捞行为必须得到中方的批准。在满足中方提出的“一个前提、四个要求”之后，中方于2002年6月18号批准了日方打捞沉船。当年9月11日，日方打捞完毕并撤离该海域，并向中方支付1亿5000万日元，用于补偿中方的渔业损失。
一个月后，日本海上保安厅公布了调查结果和回收物的照片，在船上发现了火箭发射器和冲锋枪等7种武器和一些物品，部分武器上刻有朝鲜文字。日本政府当天宣布已打捞的船只是“朝鲜间谍船”。
日本一口咬定间谍船来自朝鲜朝鲜否认
2003年，日本方面公开展示了这艘“间谍船”。它配有4台俄制大功率发动机，时速高达33节，是普通渔船的10倍;打开船尾的两扇大门，里面隐藏着一艘小型快艇。船上有两个开关，一旦遇到麻烦的话，按下开关，那么船只就会自爆沉没。另外，船内还隐藏着一门14.5毫米的小炮，没事的时候就隐藏在船舱内，一旦有事的话，能在短短数秒钟之内推到射击炮位前。另外船上还有好多的日本罐头，不同型号的日本短波收音机，全球定位系统和相关的通讯器材。甚至打捞出来的日本手机还记录有打给日本黑帮的电话号码。
日本方面一口咬定该间谍船来自朝鲜，而朝鲜方面一直断然否认，并强烈谴责日本袭击船只的行为，称这是“残暴的海盗行为”和“现代恐怖主义”

当时日本舰船侵入东海识别区、小日本当时之猖狂，无视我海军之力