一、总则
　（一）军队属于国家，军人责任在于卫国爱民。
　（二）军队建制应依国防需要，并按照国家一般教育及科学与工业之进步，改进其素质与装备。
　（三）军队制度应依我国民主政制与国情实行改革。
　（四）改善征兵制度，公平普遍实施，并保留一部分募兵制度，加以改善，俾符合高度装备军队之需要。
　（五）军队教育应依建军原则办理，永远超出党派系统及个人关系之外。
二、整军原则
（甲）实行军党分立
　（一）禁止一切党派在军队内有公开的或秘密的党团活动，军队内所有个人派系之组织与地方性质之系统，亦一并禁止。
　（二）凡军队中已有党籍之现役军人，于其在职期间，不得参加其驻地之党务活动。
　（三）任何党派及个人不得利用军队为政争之工具。
　（四）军队内部的有任何特殊组织与活动。
（乙）实行军民分治
　（一）凡在军队中任职之现役军人，不得兼任行政官吏。
　（二）实行划分军区，其区域之范围，应尽量使与行政区不同。
　（三）严禁军队干涉政治。
三、实行以政治军办法
　（一）在初步整军计划完成时，即改组军事委员会为国防部，隶属于行政院。
　（二）国防部长应不以军人为限。
　（三）全国军额及军费应经行政院决议，立法院通过。
　（四）全国军队应收国防部之统一管辖。
　（五）国防部内设一建军委员会，负建军计划及考核之责。（此委员会由各方人士参加）
四、实施整编办法
　（一）军事三人小组应照原定计划尽速商定中共军队整编办法，整编完竣。
　（二）中央军队应依军政部原定计划，尽速于六个月内完成其九十师之整编。
　（三）上两项整编完竣，应再将全国所有军队统一整编为五十师或六十师。
　（四）军事委员会内应即设置整编计划考核委员会，由各方人士参加组织之。
1946年《中华民国宪法》重复了政协决议的内容，明确规定了军队国家化，军队超出政党的原则：「全國陸海空軍，須超出個人、地域及黨派關係以外，效忠國家，愛護人民。」（第一百三十八條）與「任何黨派及個人不得以武裝力量為政爭之工具。」（第一百三十九條）基于此，1947年国民政府作为看守政府进行行宪准备时，依照宪法规定与政协决议之军队国家化程序，废除了抗战时期设置的国防委员会，并将国军（此时其并非国民革命军简称）移交行政院国防部指挥。特别值得一提的是，1945年国民党即已取消了国军中的党务组织，虽然国民党中央委员仍有不少军人，但虽有党籍，却不做党的活动[15]。随后由于动员戡乱临时条款和台湾戒严的形势，国军在迁台后曾恢复国民党党务组织，但终在總統蔣經國解嚴，繼任的李登輝废止动戡之后彻底实现了军队国家化。